代謝組學的研究對象大都是相對分子量在1000以內的小分子物質,因此常用的血液樣本在取樣后,應小心操作,防止溶血,盡快分離出血清,分置于溫環(huán)境下保存。由于用于理實驗的動物采集相對其他樣品的采集,操作更繁瑣,在處理過程中許多細節(jié)容易忽略,造成數據不完美(甚至不能用)。因此接下來將重點介紹樣品采集的注意事項及其固定。樣品采集注意事項應新鮮,操作時間盡可能短,否則細胞發(fā)生死后變化、自融及現象。是動物心臟還在跳動時采集,樣本取出后在5分鐘以內置于固定液內,避免長時間暴露在空氣環(huán)境中。塊盡量小而薄。塊的厚度以不超過5mm為宜,較為理想的厚度為2mm左右,主要目的是使固定液迅速而均勻的滲入塊內部。勿使塊受擠壓。在采集過程中,應盡量選擇較為鋒利的手術,如手術刀片等,避免操作過程中擠壓挫傷標本。擠壓過的均不可用。固定液的量一般以塊大小的20倍為宜,能夠在容器內自由移動。盡量保持的原有形態(tài)。新鮮經固定后,或多或少產生收縮現象(如胃腸),為此可將展平,以盡可能維持原形。保持清潔。塊上如有血液、污物、粘液、食物、糞便等,可用生理鹽水沖洗,然后再入固定液,但要注意防止損傷。要熟悉采集部位。要能準確的按解剖部位采集。免疫系統,人體的免疫系統由免疫細胞、免疫分子構成。海南外包科研技術服務培養(yǎng)
靜置25分鐘后把酒精倒干,用吸水紙吸出多余的酒精,然后配壓縮膠,同樣的操作,關鍵是梳子要插得快,要小心梳子下產生氣泡,然后靜置30分鐘。如果是當天跑膠,我會等上層膠凝2個小時再用,但要注意防干燥縮水,可以在一個小時的時候沿著梳子上緣加點電泳液。所以我一般提前一晚制膠,泡于純水或者電泳液里置于4度冰箱暫存。三、蛋白電泳1、上樣前準備把膠組裝到電泳芯上,注意密閉性(否則漏液),如果內槽漏液就不是勻強電場了,條帶可能就不是一條直線。然后內槽倒?jié)M電泳液,拔梳子,這一步要小心,梳子要兩邊一起緩緩往上拔出,然后觀察泳道內有無脫落的膠粒或者膠絲,有的話用1毫升注射器吸出。然后從冰箱取出蛋白樣品,解凍。準備振蕩器。2、上樣和電泳注意,上樣后蛋白會開始慢慢在膠中彌散,所以上樣越快越好。我習慣先上蛋白Marker,再上蛋白樣品,蛋白上樣前確保樣品完全解凍和充分振蕩(推薦使用振蕩器振蕩),吸的時候沒有拉絲即可,建議上樣分鐘把樣品從冰上取出來,不然樣品中SDS可能會結晶析出,從而影響電泳效果。上層膠80V25分鐘,下層膠120V65分鐘。四、轉膜1、轉膜前準備我會在電泳結束0分鐘準備,把轉膜液配好置于4度冰箱預冷,然后裁膜,準備轉膜裝置。廣西兔科研技術服務服務protocol 分享|過表達細胞株的構建。
如胰腺,一般取胰島較多的胰腺尾部;肺應取有細支氣管及帶有軟骨片的小支氣管部。如果實驗需進行多樣本的采集,采集順序應按照:消化,神經系統,皮膚,肌肉等的順序進行。選好塊的切面。熟悉某些成分安排,然后決定其切面的走向;如一長管狀以橫切面較好。切除不需要的部分。特別是周圍的脂肪等,應盡可能掉,否則給固定、脫水、浸蠟、切片等帶來一些不必要的問題。樣品的固定(1)固定的方法:①小塊固定法:從動物取下的小塊,立即置入液態(tài)固定劑(這是應用經常的方法)。②注射/灌注固定法:某些塊由于體積過大或固定液極難滲入內部或需要對整個臟器或整個動物進行固定,這時宜采用注射固定法,將固定液注入血管,經血管分支到達整個和全身,從而得到充分的固定。另,空腔比如肺,肺內含有空氣,固定液難以滲入,建議先做肺灌注,使得肺充盈滿固定液以后再進行保存,如果空腔中氣體沒有排出,后續(xù)可能影響固定效果(沒有灌注的肺會浮在液體表面不利于固定,切片以后也會看到很多的空泡)。③蒸汽固定法:比較細小而薄的標本,可用鋨酸或甲醛蒸汽固定。主要用于血液或細胞涂片以及某些薄膜的固定。。
小鼠尾尖用酒精擦拭尾巴,引起輕微的血管擴張;用無菌手術刀、刀片或鋒利的剪刀,快速截斷小鼠尾尖1-2毫米。如果需要多次,之后每次需截除2-3毫米;從尾部像尾尖方向按摩,增加血流;用采集血液;結束后,按壓傷口或使用止血劑來止血;每次量大約可達。小鼠眼球取血單手保定好小鼠;必要時剪掉小鼠胡須,防止污染血液;輕壓取血側眼部皮膚,使眼球充血突出;用彎頭鑷夾取眼球并快速在摘??;同時用左手中指輕按小鼠心臟部位,以加快心臟泵血速度;當血液流盡時,用脫臼法處死小鼠;大鼠眼眶取血先將小鼠進行麻醉,大鼠翻正反射消失時不在繼續(xù)麻醉;抗凝處理過的玻璃毛細采樣管,掰成2-3厘米長度;右手食指和拇指輕按眼眶兩側皮膚,使眼球突出,毛細管從內側的眼球與眼瞼的縫隙處進入,輕輕旋轉毛細管,稍微深入眼球后上方,血液流速快的時候4-5滴即可,溫柔的將毛細管取出;用棉簽按壓大鼠眼眶止血,每次可取血50-100微升,將血液放入冰盒中保存。小鼠心臟取血先將小鼠麻醉,稍靠右側平躺在手術板上固定;左側第三四根肋骨間觸摸心臟,跳動明顯,慢慢進針;針有回血停止進針,開始取血;一次可以300到500微升,小鼠存活,放到加熱墊上待小鼠蘇醒后放入籠中。動物疾病模型作為研究工具,在探索疾病發(fā)展和檢查的過程中發(fā)揮了巨大的作用。
首先,預實驗必須要當做正式實驗來對待(態(tài)度要放端正,這是必須的)。預實驗的每一步都需要詳細規(guī)劃,多方籌謀。不論是實驗動物的選擇,還是檢測試劑的購買,都盡量和正式實驗統一標準。建議大家先把所有試劑和購買完畢后,再去購買實驗動物。因為動物會長胖,長胖后給劑量就要增加,不僅多花錢,并且還容易影響實驗效果。筆者曾經提前將實驗動物買回,但因為特殊原因沒能購買到造模,終只能忍痛割愛將動物贈送他人,白白虧了一筆血汗錢(那批老鼠在我這兒白吃白喝長得太胖,沒辦法用作造模)。動物及試劑購買首先需要考慮:實驗動物品種、體重、性別、周齡(通常根據既往文獻報道可以獲得答案)、數量(需要考慮到實驗有一定動物死亡率或者動物本身會打架互毆,因此需要提前購買足夠的動物)。動物購買的途徑、安置的地點,飲食管理(一般實驗室會有動物房,也可以從其他地方購買),動物免證明、倫理證明需要提前準備好。實驗相關的試劑和:比如造模和,動物干預所需,陽性選擇及購買(有些購買很困難,必須通過特殊程序才能買到)。如果涉及到有創(chuàng)操作,要提前準備好(建議提前購買),手術。需要了解自身實驗平臺能完成哪些技術。由于大部分研究使用到的是人類來源的細胞,種植到免疫正常的動物體內會發(fā)生免疫排斥反應。廣西兔科研技術服務服務
細胞的功能也是細胞生物學的研究重點之一。海南外包科研技術服務培養(yǎng)
m6A修飾圖譜構建及作用機制:通過m6A甲基化測序(MeRIP-Seq,miCLIP)構建疾病細胞模型或者發(fā)病組織的m6A修飾譜,分析m6A的motif,peaks數量及分布,Peak關聯基因的特征,聯合RNA-seq研究m6A甲基化與表達的關系。m6A研究思路方案一方案二研究案例1、.(IF=)為研究ALKBH5的m6A作用機制,作者利用芯片和m6A-seq篩選到膠質瘤增殖相關的FOXM1,通過qPCR、WB、免疫熒光、核質分離WB/qPCR、RIP和MeRIP等實驗證明ALKBH5通過去甲基化調節(jié)FOXM1在GSCs中的表達。為研究ALKBH5對FOXM1的作用是否受其他因子的調節(jié),作者研究了FOXM1的鄰近基因,發(fā)現lncRNAFOXM1-AS與FOXM1序列互補,且共表達、共定位,進一步通過RIP,RNApulldown等實驗證明lncRNAFOXM1-AS促進ALKBH5和FOXM1初級轉錄本的相互作用。通過細胞實驗進一步驗證ALKBH5在lncRNAFOXM1-AS的作用下維持FOXM1的表達和細胞增殖,從而維持GSCs的干性。圖3ALKBH5敲除細胞中m6A修飾的特征和基因表達的變化2、RNAN6-methyladenosinemethyltransferaseMETTL3promoteslivercancerprogressionHepatology,2017.(IF=)表觀遺傳改變極大地促進了人類癥的發(fā)生。傳統的表觀遺傳研究主要集中在DNA甲基化,組蛋白修飾和染色質重構。近。海南外包科研技術服務培養(yǎng)