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3)基因/蛋白質(zhì)表達(dá)定性或定量檢測(cè)在進(jìn)行分子檢測(cè)的過(guò)程中,保持核酸和蛋白質(zhì)的完整性至關(guān)重要,因此在取樣過(guò)程中,應(yīng)盡量避免核酸及蛋白質(zhì)的降解。如不注意采樣過(guò)程,將會(huì)導(dǎo)致樣本中的核酸及蛋白質(zhì)的無(wú)差別降解,嚴(yán)重影響后續(xù)分子檢測(cè)結(jié)果。在條件允許的情況下,樣本在離體后應(yīng)立刻裝入凍存管內(nèi),并立即放入液氮中進(jìn)行冷凍。在RNA提取樣本的保存過(guò)程中,可以選擇非冷凍型RNA保存液或Trizol試劑進(jìn)行RNA酶的。針對(duì)蛋白質(zhì)提取樣本的保存,我們同樣可以使用商品化的蛋白酶劑進(jìn)行短期處理。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PolymeraseChnReaction,PCR)及免印跡(Westernblotting,WB),這兩種實(shí)驗(yàn)手段是分子學(xué)檢測(cè)中不可或缺的一部分,也是發(fā)表至關(guān)重要的分子檢測(cè)數(shù)據(jù)。PCR主要用來(lái)對(duì)基因在基因組層面或轉(zhuǎn)錄層面的變化進(jìn)行定性或定量檢測(cè),而WB則主要用來(lái)對(duì)某一蛋白質(zhì)的表達(dá)進(jìn)行定量檢測(cè)。(4)轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)及代謝組學(xué)檢測(cè)隨著檢測(cè)水平及相關(guān)產(chǎn)業(yè)的不斷發(fā)展,各類組學(xué)檢測(cè)的價(jià)格降低,實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)中也常常運(yùn)用組學(xué)檢測(cè)來(lái)提升實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)的檔次。在我們進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組學(xué)及蛋白質(zhì)組學(xué)的檢測(cè)過(guò)程中,同樣是要首先確保目標(biāo)RNA或蛋白質(zhì)的片段完整性。細(xì)胞器是細(xì)胞內(nèi)的各種功能結(jié)構(gòu),如線粒體、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)、高爾基體等,它們各自承擔(dān)著不同的生理功能。上海實(shí)驗(yàn)科研技術(shù)服務(wù)技術(shù)
靜置25分鐘后把酒精倒干,用吸水紙吸出多余的酒精,然后配壓縮膠,同樣的操作,關(guān)鍵是梳子要插得快,要小心梳子下產(chǎn)生氣泡,然后靜置30分鐘。如果是當(dāng)天跑膠,我會(huì)等上層膠凝2個(gè)小時(shí)再用,但要注意防干燥縮水,可以在一個(gè)小時(shí)的時(shí)候沿著梳子上緣加點(diǎn)電泳液。所以我一般提前一晚制膠,泡于純水或者電泳液里置于4度冰箱暫存。三、蛋白電泳1、上樣前準(zhǔn)備把膠組裝到電泳芯上,注意密閉性(否則漏液),如果內(nèi)槽漏液就不是勻強(qiáng)電場(chǎng)了,條帶可能就不是一條直線。然后內(nèi)槽倒?jié)M電泳液,拔梳子,這一步要小心,梳子要兩邊一起緩緩?fù)习纬?,然后觀察泳道內(nèi)有無(wú)脫落的膠粒或者膠絲,有的話用1毫升注射器吸出。然后從冰箱取出蛋白樣品,解凍。準(zhǔn)備振蕩器。2、上樣和電泳注意,上樣后蛋白會(huì)開(kāi)始慢慢在膠中彌散,所以上樣越快越好。我習(xí)慣先上蛋白Marker,再上蛋白樣品,蛋白上樣前確保樣品完全解凍和充分振蕩(推薦使用振蕩器振蕩),吸的時(shí)候沒(méi)有拉絲即可,建議上樣分鐘把樣品從冰上取出來(lái),不然樣品中SDS可能會(huì)結(jié)晶析出,從而影響電泳效果。上層膠80V25分鐘,下層膠120V65分鐘。四、轉(zhuǎn)膜1、轉(zhuǎn)膜前準(zhǔn)備我會(huì)在電泳結(jié)束0分鐘準(zhǔn)備,把轉(zhuǎn)膜液配好置于4度冰箱預(yù)冷,然后裁膜,準(zhǔn)備轉(zhuǎn)膜裝置。上海大鼠科研技術(shù)服務(wù)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物造模 | 膿毒癥造模方法之CLP造模法。
這種細(xì)胞保持著其原始的生物學(xué)特性,具有高度的活性和分裂能力。原代細(xì)胞在許多生物醫(yī)學(xué)研究中具有重要地位,包括藥物篩選、疾病模型的建立以及疫苗研發(fā)等。原代細(xì)胞的獲得通常是通過(guò)組織剪切、消化或酶解等方式從機(jī)體或組織中分離出來(lái)。這些細(xì)胞脫離了它們?cè)谏矬w中的環(huán)境,但是仍然保持著其基本的生物學(xué)特性,包括細(xì)胞膜、細(xì)胞核、細(xì)胞器以及其他重要的生物分子。原代細(xì)胞在未經(jīng)過(guò)傳代培養(yǎng)的情況下,保持著其原始的生物學(xué)特性,因此,它們常常被用于藥物篩選、毒理學(xué)研究等。同時(shí),由于原代細(xì)胞具有高度活性和分裂能力,它們也被用于組織工程和再生醫(yī)學(xué)中,如皮膚移植、骨頭修復(fù)和神經(jīng)再生等。此外,原代細(xì)胞模型在疾病研究中也扮演著重要角色。由于原代細(xì)胞具有更高的生物真實(shí)性,使用它們建立的疾病模型能夠更準(zhǔn)確地模擬疾病的發(fā)展過(guò)程和藥物的作用機(jī)制,從而為新藥研發(fā)和疾病治、療提供更有效的工具??傊?,原代細(xì)胞是一種具有高度活性和分裂能力的細(xì)胞,在生物醫(yī)學(xué)研究中具有重要的作用。由于其原始的生物學(xué)特性。
METTL3能夠促進(jìn)肺腺細(xì)胞的生長(zhǎng)、生存和侵襲,但還不清楚它是否作為m6A調(diào)節(jié)器或效應(yīng)器發(fā)揮作用[25]。在急性髓細(xì)胞白血?。ˋML)患者中,m(6)A調(diào)控基因的突變或拷貝數(shù)變化與TP53突變存在密切聯(lián)系,且m(6)A調(diào)控基因的改變與AML不良預(yù)相關(guān)[26]。此外,F(xiàn)TO在AML中高表達(dá),它通過(guò)降低mRNA轉(zhuǎn)錄本中的m(6)水平,調(diào)節(jié)ASB2和RARA等靶點(diǎn)的表達(dá),增強(qiáng)了白血病基因介導(dǎo)的細(xì)胞轉(zhuǎn)化和白血病形成,并抑制全反式維甲酸(ATRA)誘導(dǎo)的AML細(xì)胞分化[27]。在脂肪形成過(guò)程中,F(xiàn)TO表達(dá)與m6A水平成負(fù)相關(guān),促進(jìn)脂肪形成[3]。在膠質(zhì)細(xì)胞瘤樣細(xì)胞中,ALKBH5通過(guò)lncRNAFOXM1介導(dǎo)FOXM1基因pre-mRNA上的m6A修飾維持膠質(zhì)瘤細(xì)胞的成瘤性[28]。此外,甲基轉(zhuǎn)移酶METTL3或METTL14的敲除,能夠改變m6A的富集和ADAM19的表達(dá),極大地促進(jìn)了膠質(zhì)瘤細(xì)胞的生長(zhǎng)、自我更新和形成[29]。圖2m6ARNA修飾和介導(dǎo)的功能[30]m6A的研究方向主要是通過(guò)研究m6A修飾相關(guān)的甲基化、去甲基化酶和識(shí)別蛋白的功能,進(jìn)而研究m6A修飾的生物學(xué)功能和作用機(jī)制:一般通過(guò)敲除m6A酶分子,研究下游功能基因分子的表達(dá)和m6A甲基化情況,通過(guò)介導(dǎo)相關(guān)基因異常(可變剪切、穩(wěn)定性、翻譯、miRNA調(diào)控)影響細(xì)胞表型和功能特征。細(xì)胞的功能也是細(xì)胞生物學(xué)的研究重點(diǎn)之一。
原代細(xì)胞是指在機(jī)體或組織中直接從生物體分離出來(lái)的、未經(jīng)傳代培養(yǎng)的細(xì)胞。這種細(xì)胞保持著其原始的生物學(xué)特性,具有高度的活性和分裂能力。原代細(xì)胞在許多生物醫(yī)學(xué)研究中具有重要地位,包括藥物篩選、疾病模型的建立以及疫苗研發(fā)等。原代細(xì)胞的獲得通常是通過(guò)組織剪切、消化或酶解等方式從機(jī)體或組織中分離出來(lái)。這些細(xì)胞脫離了它們?cè)谏矬w中的環(huán)境,但是仍然保持著其基本的生物學(xué)特性,包括細(xì)胞膜、細(xì)胞核、細(xì)胞器以及其他重要的生物分子。原代細(xì)胞在未經(jīng)過(guò)傳代培養(yǎng)的情況下,保持著其原始的生物學(xué)特性,因此,它們常常被用于藥物篩選、毒理學(xué)研究等。同時(shí),由于原代細(xì)胞具有高度活性和分裂能力,它們也被用于組織工程和再生醫(yī)學(xué)中,如皮膚移植、骨頭修復(fù)和神經(jīng)再生等。此外,原代細(xì)胞模型在疾病研究中也扮演著重要角色。由于原代細(xì)胞具有更高的生物真實(shí)性,使用它們建立的疾病模型能夠更準(zhǔn)確地模擬疾病的發(fā)展過(guò)程和藥物的作用機(jī)制,從而為新藥研發(fā)和疾病治、療提供更有效的工具??傊?xì)胞是一種具有高度活性和分裂能力的細(xì)胞,在生物醫(yī)學(xué)研究中具有重要的作用。由于其原始的生物學(xué)特性??梢苑€(wěn)定的WB精髓與經(jīng)驗(yàn)分享。廣西豚鼠科研技術(shù)服務(wù)服務(wù)
科研技術(shù)服務(wù)不僅提升了科研項(xiàng)目的成功率,也促進(jìn)了科研人才的培養(yǎng)與發(fā)展。上海實(shí)驗(yàn)科研技術(shù)服務(wù)技術(shù)
我們知道WB實(shí)驗(yàn)步驟繁瑣,一次實(shí)驗(yàn)歷時(shí)也不短,從提蛋白到顯影結(jié)束可能要三天,我們就講一下這里面的一些關(guān)鍵環(huán)節(jié)。一、蛋白提取及變性1、提取蛋白很多經(jīng)驗(yàn)豐富的WB實(shí)驗(yàn)者都深有體會(huì),蛋白提取是影響結(jié)重要的環(huán)節(jié)之一。該過(guò)程重要的是防降解和保證蛋白濃度不要太低。防降解主要有兩點(diǎn),一是裂解前注意保持樣品處于低溫環(huán)境中,二是裂解時(shí)加入足夠的蛋白酶抑制劑。我們習(xí)慣先用冰冷的PBS做心臟的體循環(huán)灌注,然后冰上取腦,分離各腦區(qū)(嗅球,皮層,海馬,中腦,小腦,延髓,丘腦,紋狀體)后置于,用液氮速凍后轉(zhuǎn)移至-80度冰箱長(zhǎng)期保存。接著是保證蛋白濃度,即要加入適量的裂解液,加太少會(huì)使蛋白提取不充分,加太多會(huì)讓蛋白濃度太低,一般經(jīng)驗(yàn)是這樣的,細(xì)胞樣品例如一個(gè)六孔板的細(xì)胞加60微升的裂解液,動(dòng)物組織的話每毫克組織加10微升裂解液。還要加上超聲破碎處理,具體方案見(jiàn)討論部分。如果沒(méi)有超聲破碎儀,那就用1毫升注射器不斷抽吸,冰上反復(fù)抽吸1分鐘左右,注意不要產(chǎn)生過(guò)多氣泡。(需要灌注取材的視頻可以私聊獲取,由于文件過(guò)大,又比較血腥,不宜直接放到文章里。)2、蛋白變性加入上樣緩沖液后100攝氏度煮10分鐘,這里的上樣緩沖液有兩種可選。上海實(shí)驗(yàn)科研技術(shù)服務(wù)技術(shù)