我們知道WB實驗步驟繁瑣,一次實驗歷時也不短,從提蛋白到顯影結(jié)束可能要三天,我們就講一下這里面的一些關(guān)鍵環(huán)節(jié)。一、蛋白提取及變性1、提取蛋白很多經(jīng)驗豐富的WB實驗者都深有體會,蛋白提取是影響結(jié)重要的環(huán)節(jié)之一。該過程重要的是防降解和保證蛋白濃度不要太低。防降解主要有兩點,一是裂解前注意保持樣品處于低溫環(huán)境中,二是裂解時加入足夠的蛋白酶抑制劑。我們習(xí)慣先用冰冷的PBS做心臟的體循環(huán)灌注,然后冰上取腦,分離各腦區(qū)(嗅球,皮層,海馬,中腦,小腦,延髓,丘腦,紋狀體)后置于,用液氮速凍后轉(zhuǎn)移至-80度冰箱長期保存。接著是保證蛋白濃度,即要加入適量的裂解液,加太少會使蛋白提取不充分,加太多會讓蛋白濃度太低,一般經(jīng)驗是這樣的,細胞樣品例如一個六孔板的細胞加60微升的裂解液,動物組織的話每毫克組織加10微升裂解液。還要加上超聲破碎處理,具體方案見討論部分。如果沒有超聲破碎儀,那就用1毫升注射器不斷抽吸,冰上反復(fù)抽吸1分鐘左右,注意不要產(chǎn)生過多氣泡。(需要灌注取材的視頻可以私聊獲取,由于文件過大,又比較血腥,不宜直接放到文章里。)2、蛋白變性加入上樣緩沖液后100攝氏度煮10分鐘,這里的上樣緩沖液有兩種可選。上海研錄生物醫(yī)藥為您提供一站式科研技術(shù)服務(wù)。上海外包科研技術(shù)服務(wù)購買
是整體甲基化進程所必須的[2]。FTO是ALKB家族的成員,作為個被發(fā)現(xiàn)的去甲基酶,可影響剪切因子SRSF2的RNA結(jié)合能力,進而調(diào)控pre-mRNA的剪切加工過程[3]。目前已發(fā)現(xiàn)FTO調(diào)節(jié)異常與肥胖、大腦畸形和生長遲緩相關(guān),揭示m6A可能對這些疾病具有重要的調(diào)節(jié)功能[4-6]。ALKBH5是ALKB家族中被發(fā)現(xiàn)具有去甲基作用的另一個成員,以RNaseA敏感的方式與核小斑共定位,它可直接催化m6A-甲基化腺苷去除甲基而不同于FTO的氧化去甲基化[7].此外,ALKBH5和它的去甲基化活性影響新生mRNA合的成和剪切效率[7],且ALKBH5敲除雄性小鼠表現(xiàn)出精子發(fā)生異常,這可能是精子發(fā)生相關(guān)基因表達改變的結(jié)果[7]。m6AmRNA修飾執(zhí)行其功能主要通過兩個途徑:精細調(diào)控甲基化轉(zhuǎn)錄本的結(jié)構(gòu),以阻止或誘使蛋白-RNA相互作用;或被直接由m6A結(jié)合蛋白識別,誘發(fā)續(xù)反應(yīng)。目前一類含有YTH功能結(jié)構(gòu)域的蛋白被鑒定為m6A修飾的結(jié)合蛋白。其中YTHDF1,YTHDF2,YTHDF3,YTHDC1和YTHDC2己被證實是m6A的結(jié)合蛋白.YTHDF1主要影響m6A修飾基因的翻譯,YTHDF2主要影響m6A修飾基因的降解,而YTHDC1結(jié)合m6A修飾的基因影響其剪接。HNRNPC是一種豐富的核RNA結(jié)合蛋白,參與pre-mRNA的加工[8]。海南疾病模型科研技術(shù)服務(wù)服務(wù)隨著科技的不斷進步,科研人員將能夠開發(fā)出更為精確、實用的動物模型,更好地為人類健康保駕護航。
如胰腺,一般取胰島較多的胰腺尾部;肺應(yīng)取有細支氣管及帶有軟骨片的小支氣管部。如果實驗需進行多樣本的采集,采集順序應(yīng)按照:消化,神經(jīng)系統(tǒng),皮膚,肌肉等的順序進行。選好塊的切面。熟悉某些成分安排,然后決定其切面的走向;如一長管狀以橫切面較好。切除不需要的部分。特別是周圍的脂肪等,應(yīng)盡可能掉,否則給固定、脫水、浸蠟、切片等帶來一些不必要的問題。樣品的固定(1)固定的方法:①小塊固定法:從動物取下的小塊,立即置入液態(tài)固定劑(這是應(yīng)用經(jīng)常的方法)。②注射/灌注固定法:某些塊由于體積過大或固定液極難滲入內(nèi)部或需要對整個臟器或整個動物進行固定,這時宜采用注射固定法,將固定液注入血管,經(jīng)血管分支到達整個和全身,從而得到充分的固定。另,空腔比如肺,肺內(nèi)含有空氣,固定液難以滲入,建議先做肺灌注,使得肺充盈滿固定液以后再進行保存,如果空腔中氣體沒有排出,后續(xù)可能影響固定效果(沒有灌注的肺會浮在液體表面不利于固定,切片以后也會看到很多的空泡)。③蒸汽固定法:比較細小而薄的標(biāo)本,可用鋨酸或甲醛蒸汽固定。主要用于血液或細胞涂片以及某些薄膜的固定。。
用途基因功能研究、免/殺傷/增殖等、抗體活性篩選(細胞水平的結(jié)合和阻斷)、CAR分子的殺傷活性評價。材料與儀器(以慢pMSCV載體為例)包含目的基因和eGFP-Tag的pMSCV質(zhì)粒、帶有eGFP-Tag的pMSCV空載質(zhì)粒、GAG質(zhì)粒、VSV質(zhì)粒、Puromycin、Polybrene、Lipo3000、HEK293T細胞、opti-MEM、DMEM、FBS、雙抗、μm的濾膜、熒光顯微鏡等。步驟1、基因的構(gòu)建1)根據(jù)目的基因mRNA編碼區(qū)設(shè)計引物,分別在引物兩端加入酶切位點EcoRI和BglII。2)從細胞中提取目的基因mRNA,然后逆轉(zhuǎn)錄成cDNA,然后從cDNA里面用引物把目的基因的CDS區(qū)擴增出來。PCR擴增出帶有酶切位點的目的基因編碼區(qū)序列,連接至pMD19-T載體后轉(zhuǎn)化至感受態(tài)DH5α,分別進行菌落PCR鑒定和酶切鑒定。3)使用EcoRI和BglII雙酶切下目的基因序列,電泳割膠回收純化,連接到pMSCV-eGFP載體。再次轉(zhuǎn)化到感受態(tài)DH5α,菌落PCR鑒定和酶切鑒定成功后,送至公司測序、鑒定。4)鑒定成功后,將質(zhì)粒轉(zhuǎn)化至感受態(tài)DH5α中,并進行無內(nèi)質(zhì)粒抽提。GAG質(zhì)粒和VSV質(zhì)粒同樣可以轉(zhuǎn)化至感受態(tài)DH5α中,并進行無內(nèi)質(zhì)粒抽提。質(zhì)粒抽提后冷凍于-20℃保存。2、慢包裝1)使用DMEM完全培養(yǎng)基培養(yǎng)6cm皿HEK293T至匯合度為70~80%。這項技術(shù)可用來將含有上千種不同蛋白質(zhì)的樣品中,分離和濃縮出特定蛋白質(zhì)。
中華文化促進會文化創(chuàng)新與傳播委員會會長朱建聲、西安海棠學(xué)院院長馮居秦、西安交通大學(xué)人文學(xué)院EDP中心主任、中華風(fēng)采人物媒體社長王天保、西安市EMBA助企商會會長張西安、陜西省糖尿病協(xié)會副會長張麗、陜西省養(yǎng)生協(xié)會會長李靖、陜西省職業(yè)經(jīng)理人協(xié)會名譽會長劉志超、西藏鷹山科技集團董事長張沛、西安天歌干細胞健康管理中心總經(jīng)理楊海軍和團隊及各行各業(yè)企業(yè)界朋友、受益者近200人參與了活動。西安天歌干細胞健康管理有限公司總經(jīng)理楊海軍介紹了成立一年來的工作情況和未來的發(fā)展布局。隨后,天歌干細胞健康管理中心負責(zé)人分別同中華文化促進會文化創(chuàng)新與傳播委員會會長朱建聲;西安市(EMBA助企商會)/西安市EMBA商會會長張西安;鄭州天歌干細胞健康管理有限公司總經(jīng)理張永紅和上海豪景醫(yī)療器械有限公司總經(jīng)理張建國進行了簽約儀式。主持人同中華風(fēng)采人物媒體社長、新時代風(fēng)采人物研究會會長、文化名人收藏大家王天保,中華風(fēng)采人物媒體主編李西紅,西藏鷹山科技集團董事長張沛分別從幾個話題闡述和討論了大健康產(chǎn)業(yè)的未來前景。為了答謝各界朋友的的支持與厚愛,活動舉行了現(xiàn)場抽獎環(huán)節(jié),將活動掀起了高潮。通過活動一方面讓大家和身邊的朋友更關(guān)注健康。實驗干貨 | 分子克隆實驗——無縫克隆。湖南外包科研技術(shù)服務(wù)培養(yǎng)
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圖2MAZTER-Seq實驗流程圖圖3MAZTER-MINE分析m6A示意圖接下來作者便是要驗證這一新方法的可行性了。在酵母中敲除IME4的情況下,檢測到的剪切效率高于野生型(剪切效率高低m6A水平),m6A抗體富集后的樣品剪切效率也低于未富集的Input組。整體水平可靠,那檢測的特異性位點是否準(zhǔn)確呢?作者也將該方法檢測到的新甲基化位點使用放射標(biāo)記層析檢測,發(fā)現(xiàn)預(yù)測的位點準(zhǔn)確存在而且與剪切效率相符合。如圖5所示。而圖6中,作者則是與m6A抗體IP的方法進行了比較,也證實了這一方法的可行性。圖5MAZTER-Seq檢測結(jié)果驗證圖6MAZTER-Seq與m6A-Seq比較分析此外,后文中作者也在大規(guī)模的CRISPR-Cas9改變m6A狀態(tài)和酵母減數(shù)分裂模型中檢測了MAZTER-Seq這一系統(tǒng);并進一步通過這一方法檢測了哺乳動物不同細胞間m6A水平的保守性;也探究了去甲基化酶FTO對整體m6A甲基化水平的影響等。這里小編主要給大家分享這一新技術(shù),其他部分暫不過多分析了。新的技術(shù)能拓展我們的研究內(nèi)容;對于這一技術(shù)。上海外包科研技術(shù)服務(wù)購買